刺齿报春苣苔肌醇半乳糖苷合成酶基因的鉴定及序列分析
覃信梅,卢永彬,江祈贵,黄章平,黄夕洋
江苏农业科学,2019,47(8) : 56-60.
摘要
肌醇半乳糖苷合成酶基因与植物光合产物运输、种子耐脱水性、抵御生物与非生物胁迫和自我保护等生理生化过程密切相关。基于刺齿报春苣苔( Primulina spinulosa) 转录组测序数据,获得(鉴定) 1 个肌醇半乳糖苷合成酶基因。序列分析结果表明,该基因全长1347 bp( GenBank 登录号为MG521418) ,开放阅读框( ORF) 为 1008 bp,共编码 335 个氨基酸。进一步基于氨基酸序列的分析表明,该基因编码的蛋白质分子量为 38.05 ku,理论等电点为 5.09,为亲水性蛋白,含有1 个与糖基转移酶家族蛋白相同的保守结构域; 刺齿报春苣苔的肌醇半乳糖苷合成酶基因与同科的旋蒴苣苔( Boea hygrometrica,FJ222452) 的相似性高达 90% ,两者在系统进化树上聚为1支。研究结果为进一步研究刺齿报春苣苔的肌醇半乳糖苷合成酶基因的分子结构和功能奠定了基础。
图1 测定的刺齿报春苣苔肌醇半乳糖苷合成酶基因系列和推测的氨基酸序列
图2 刺齿报春苣苔肌醇半乳糖苷合成酶的疏水性分析结果
图3 刺齿报春苣苔肌醇半乳糖苷合成酶保守结构域
图4 刺齿报春苣苔肌醇半乳糖苷合成酶基因编码蛋白的跨膜区预测结果
图5 刺齿报春苣苔肌醇半乳糖苷合成酶蛋白信号太多分析结果
图6 刺齿报春苣苔肌醇半乳糖苷合成酶基因的二级结构预测结果
图7 SWISS-Model模拟的刺齿报春苣苔肌醇半乳糖苷合成酶蛋白的三级结构
图8 基于氨基酸序列的刺齿报春苣苔肌醇半乳糖苷合成酶系列发育树